GEREMIA, SILVANO

Silvano Geremia studied chemistry at University of Trieste, where he received his B.S. degree in 1988 and his Ph.D. degree in 1991 (University consortium Trieste-Venice-Ferrara). He was postdoctoral Fellow at Elettra Synchrotron Trieste, Italy and University of Erlangen-Nuremberg, Germany in 1992-1993. In 1994 he was appointed Assistant Professor at the University of Ancona. In 1996 he moved to University of Trieste as Assistant Professor. Academic Visitor at the University of Oxford, UK in 1998. He was appointed Associate Professor in 2002 at University of Trieste. 2012-2018 Head of Department of Chemical and Pharmaceutichal Sciences and Member of the Academic Senate. 2012-2020 member of the Administrative Council of the University College for Sciences “L. Fonda”. He has obtained the National Scientific Qualification as Full professor C.C. 03/B1 in 2013 and in 2019. Member of the International Steering committee “Chemistry towards Biology” from 2013. Editorial Board Member of “Molecules” from 2018. Member of Proposal Review Panels of Elettra synchrotron from 2018. Board Member of the Interuniversity Research Consortium in Chemistry of Metals in Biological Systems from 2019. He coordinates the Centre of Excellence in Biocrystallography and he is member of the Doctoral School in Chemistry. He teaches General and Inorganic Chemistry; Structural Chemistry with Synchrotron Light; Diffraction techniques; Metals in Medicine for undergraduate chemistry students. Responsible of UniTS unit of a PRIN2017 project he was involved in various research projects. He was supervisor of 6 PhD thesis, several Bachelor’s and Master’s thesis and 12 post-doc. Co-author of more 200 papers published in renowned international journals with high impact factor with about 6000 citations (H-index = 40). He has an extensive experience in crystallography and his research is focused on structural studies on supramolecular and protein systems. He has performed experiments using synchrotron radiation at various laboratories: Elettra (Trieste, I), ESRF (Grenoble, F), SRS (Daresbury, UK), LURE (Orsay, F), HASYLAB (Hamburg, D). Recent major achievements include: The development of an interpretative model of PGSE data to understand the hierarchical self-assembly mechanisms of a host-guest supramolecular polymer (Polymer Chemistry, 2021); the structural characterization of a new class of host macrocycles called prismarenes (JACS, 2020, 142, 1752) and of a class of naphthalene – phenol hybrid hosts (Org. Let., 2020, 22, 6166); the determination of the crystalline structure of a cytochrome c / calixarene octaanionic complex which allowed to understand the importance of the charge in the formation of porosity in protein crystals (Org. Biomol. Chem., 2020, 18, 211); the characterization and definition of the inherent chirality in cycloparaphenylenes (JOC 2019, 84, 9489); the characterization of the first complex with gyrobifastigium geometry (JACS, 2017, 139, 8371; ChemComm, 2016, 52, 11243); the determination of the structure of Fe-III complexes that catalyze the development of hydrogen (ChemSusChem, 2017, 10, 4430); the structural characterization of manganese-based chimeric heme and non-heme complexes with antioxidant properties (ACS Catalysis, 2017, 7, 1971); the origin of the selective recognition of amino acids by tetraphosphonate cavitands (JACS, 2016, 138, 8569); the supramolecular recognition of BTEX (benzene, toluene, ethylbenzene and xylenes) by tripticene-quinoxanthine cavitands (Chemistry, 2016, 22, 3185); a general exit strategy of cytochromes c in electron transfer complexes (IUBMB life 2015); He is currently involved in numerous national and international collaborations, the most relevant are with: prof. E. Dalcanale, of the University of Parma, for the characterization of supramolecular systems based on cavitands; Prof. M.F. Parisi of the University of Palermo for the characterization of supramolecular systems based on calix [5] arenes; Prof. C. Gaeta and P. Neri of the University of Salerno for the characterization of new host macrocyclic systems such as prismarenes; Prof. P. Marcos of the University of Lisbon for studies on dihomooxacalixarens; Prof. R. Purrello of the University of Catania for the study of calixarene / porphyrin systems; Prof. P.B. Crowley of the National University of Ireland in Galway for the study of protein-calixarene interactions; Prof. S. Key of the Polytechnic of Lausanne for supramolecular coordination systems that form macro-cages; Prof. M. Bonchio of the University of Padua for the development of metal-based catalysts for water splitting and as antioxidants; Dr. V. De Re and Dr. G. Toffoli of the Aviano Oncology Reference Center for the development of HCV vaccines and for the study of the interactions between irinotecan and HLA-G. In the past, the main and most important international collaborations were carried out with prof. D.N. Reinhoudt, Laboratory of Supramolecular Chemistry and Technology, Mesa + Research Institute of University of Twente NL, for the structure determination of nanocapsules based on ionic interactions for storage and transport of small molecules; with prof. W. F. DeGrado, Department of Biochemistry & Biophysics, University of Pennsylvania U.S.A., for structural studies on de-novo design artificial metalloproteins containing the "four-helix bundle" motif; with Prof. L. N. Johnson, Laboratory of Molecular Biophysics, University of Oxford, for biocrystallographic studies on phosphorylase enzymes.

- Nato a Portogruaro (Venezia) il 1 Novembre 1963. - 1988 Laurea in Chimica presso l’Università degli Studi di Trieste. - 1992 Dottorato in Scienze Chimiche presso il consorzio universitario Ferrara/Venezia/Trieste. - 1992-1993 Borsista della Sincrotrone Trieste S.c.p.A., con stages presso l'Institut für Angewandte Physik, University of Erlangen-Norimberga Prof. H. Burzlaf e sincrotroni DESY-Amburgo, Orsay-Parigi e ESRF-Grenoble. - 1994-1996 Ricercatore in Chimica Generale ed Inorganica presso la Facoltà di Scienze Matematiche Fisiche e Naturali dell'Università degli Studi di Ancona. - 1996-2002 Ricercatore in Chimica Generale ed Inorganica presso la Facoltà di Scienze Matematiche Fisiche e Naturali dell’Università degli Studi di Trieste. - 1998 Academic Visitor presso il Molecular Biophysics Laboratory del Department of Biochemistry, University of Oxford (England) Prof. Dame Louise Johnson. - 2002- - Professore Associato in Chimica Generale ed Inorganica presso l’Università degli Studi di Trieste. - 2003-2006 Membro Collegio di Dottorato in Scienze Chimiche. - 2005-2007 Membro Collegio di Dottorato in Medicina Molecolare. - 2010-2014 Membro Collegio della Scuola di Dottorato di Ricerca in Scienze e Tecnologie Chimiche e Farmaceutiche. - 2011 Membro della Commissione per la Redazione dello Statuto di UniTS. - 2012-2018 Direttore di Dipartimento di Scienze Chimiche e Farmaceutiche. - 2012-2018 Membro del Senato Accademico di UniTS. - 2012-2020 Consigliere di Amministrazione del Collegio delle Scienze L. Fonda. - 2013 e 2019 Abilitazione Scientifica Nazionale a Professore Ordinario nella Classe Concorsuale 03/B1. - 2013- - Membro Collegio di Dottorato in Chimica - 2013- - Membro Steering committee internazionale “Chemistry towards Biology” - 2018- - Membro Editorial Board “Molecules” (MDPI) - 2018- - Membro Proposal Review Pannels Sincrotrone Elettra - 2019- - Membro Direttivo CIRCMSB - Consorzio Interuniversitario di Ricerca in Chimica dei Metalli nei Sistemi Biologici Ha in affidamento i seguenti corsi/moduli d’insegnamento: Chimica Generale ed Inorganica con Laboratorio, Modulo A, 8 CFU (Laurea in Chimica) Strutturistica Chimica con Luce di Sincrotrone, 6 CFU (Laurea magistrale di Chimica) Tecniche di Diffrazione, 2 CFU (Laurea in Chimica) Metalli in Medicina, 2 CFU (Laurea in CTF) S. Geremia lavora presso il Dipartimento di Scienze Chimiche Farmaceutiche dove coordina il Centro di Eccellenza in Biocristallografia (CEB). E’ responsabile locale del Progetto PRIN 2017 (2019-2022): «Functional supramolecular polymers for self-diagnostic composites». E’ stato responsabile scientifico di diversi progetti di ricerca relativi a precedenti PRIN e conto terzi per Basf, Chiesi Farmaceutici e Dr. Schär spa ed ha partecipato a vari gruppi di ricerca di progetti PRIN, FIRB, AIRC e progetti regionali. E’ stato relatore di 6 tesi di dottorato e di diverse tesi magistrali e triennali ed ha coordinato l’attività di ricerca di 12 post-doc. Svolge il ruolo di referee per numerose riviste internazionali ed è stato valutatore PRIN, CIVR e VQR. E’ co-autore di più di 200 lavori, pubblicati in riviste internazionali con referee con circa 6000 citazioni e con H-index=40 (Scopus) Ha una vasta esperienza in cristallografia e la sua ricerca è principalmente rivolta verso gli studi strutturali di sistemi supramolecolari e proteici. Ha effettuato i suoi esperimenti usando la radiazione di sincrotrone presso vari laboratori: Elettra (Trieste, I), ESRF (Grenoble, F), SRS (Daresbury, UK), LURE (Orsay, F), HASYLAB (Amburgo, D). I più importanti e recenti successi ottenuti nella ricerca riguardano: Lo sviluppo di un modello interpretativo di dati PGSE finalizzato a comprendere i meccanismi di autoassemblaggio gerarchico di un polimero supramolecolare di tipo host-guest (Polymer Chemistry, 2021); la caratterizzazione strutturale di una nuova classe di macrocicli host chiamata prismareni (JACS, 2020, 142, 1752) e di una classe di host ibridi naftalene–fenolo (Org. Let., 2020, 22, 6166); la determinazione della struttura cristallina di un complesso citocromo c / calixarene ottaanionico che ha permesso di comprendere l’importanza della carica nella formazione della porosità nei cristalli proteici (Org. Biomol. Chem., 2020, 18, 211); la caratterizzazione è la definizione della chiralità inerente nei cicloparafenileni (JOC 2019, 84, 9489); la caratterizzazione del primo complesso con geometria gyrobifastigium (JACS, 2017, 139, 8371; ChemComm, 2016, 52, 11243); la determinazione della struttura di complessi Fe-III che catalizzano lo sviluppo di idrogeno (ChemSusChem, 2017, 10, 4430); la caratterizzazione strutturale di complessi chimerici eme e non-eme a base di manganese con proprietà antiossidanti (ACS Catalysis, 2017, 7, 1971); l’origine del riconoscimento selettivo di amino acidi ad opera di cavitandi tetrafosfonati (JACS, 2016, 138, 8569); il riconoscimento supramolecolare di BTEX (benzene, toluene, etilbenzene e xileni) ad opera di cavitandi tripticene-quinoxantine (Chemistry, 2016, 22, 3185); l’ipotesi di un meccanismo generale di uscita del citocromo c nei complessi di trasferimento elettronico (IUBMB life 2015, 67, 694); lo sviluppo di un metodo per la determinazione della selettività relativa in sistemi host-guest basato sulla diffrazione a raggi-X da cristallo singolo (CrystEngComm, 2014, 16, 10987); la caratterizzazione di recettori per amine (JOC, 2012, 77, 9668); la caratterizzazione di recettori fluorescenti per alcooli (Angew. Chem. 2011, 123, 4750); la funzionalizzazione di cristalli nanoporosi di sistemi supramolecolari a base porfirina/cavitando mediante diffusione di ioni (JACS, 2009, 131, 2487); la caratterizzazione di nuovi polimeri supramolecolari basati sull’interazione host-guest (Angew. Chem., 2008, 47, 4504); la caratterizzazione di un catalizzatore polioxometallato di rutenio che sviluppa in maniera estremamente efficiente ossigeno molecolare (JACS, 2008, 130, 5006); la caratterizzazione di un nuovo materiale poroso che mostra un comportamento spin-crossover a temperatura ambiente (Advanced Material, 2007, 19, 1397); la determinazione della prima struttura tridimensionale di una proteina di trasporto della vitamina B12 (PNAS, 2006, 103, 4386) e lo sviluppo razionale di un bioconiugato dalla B12 a base di gadiolino citotossico per cellule tumorali (Chemistry, 2009, 15, 7980); la caratterizzazione mediante tecniche di epitope-excision degli epitopi presenti nelle proteine HCV-NS3 e IgG-Fc riconosciute degli anticorpi IgM di pazienti affetti da crioglobulinemia mista (Leukemia, 2006, 20, 1145); lo sviluppo di metodiche per la simulazione della diffusione di substrati in cristalli di proteina (Structure, 2006, 14, 393); il riconoscimento del ruolo dello ione metallico e dell'intorno proteico nella coordinazione di leganti esogeni in proteine artificiali "four-helix bundle" (JACS, 2005, 127, 17266); l'analisi e il design di turn in sistemi proteici artificiali elica-turn-elica (JMB, 2005, 346, 1441); la determinazione della struttura di una delle più grandi gabbie supramolecolari (JACS, 2004, 116, 6516); la prima struttura a raggi X di una eme proteina miniaturizzata (JBIC, 2004, 9, 1017); la scoperta di un nuovo meccanismo di scivolamento di alfa eliche in metallo-proteine da de-novo design (Angew. Chem., 2003, 42, 417); la caratterizzazione mediante raggi X di una capsula molecolare basata su interazioni ioniche (JACS, 2003, 125, 9946); la descrizione di nuovi materiali dinamici ottenuti dall'autoassociazione di cavitandi controllata sia dal solvente sia dalla coordinazione a metalli (Angew. Chem., 2003, 42, 1344); la descrizione della relazione tra il network di legami ad idrogeno e il potenziale di riduzione nei citocromi di c-tipo (FEBS Let., 2002, 516, 285); la catalisi enzimatica nei cristalli di proteina (JMB, 2002, 322, 413); la determinazione mediante raggi X dei complessi supramolecolari calixarene-porfirina caratterizzati da una stechiometria dipendente dal pH (Angew. Chem, 2001, 40, 4245); la descrizione della struttura di una proteina artificiale con motivo "four-helix bundle" cataliticamente attiva (JACS, 2001, 123, 12749); la prima struttura cristallina di una proteina da de-novo design con motivo "four-helix bundle" (PNAS, 2000, 97, 6298); la descrizione della struttura di sistemi supra-molecolari metallo-porfirinici (Angew. Chem 2000 39 1096); la rivelazione del meccanismo di riconoscimento e di fosforolisi dei substrati oligosaccaridici negli enzimi fosforilasi (EMBO J., 1999, 18, 4619). E' coinvolto attualmente in numerose collaborazioni nazionali ed internazionali, le più rilevanti sono con: il prof. E. Dalcanale, dell'Università di Parma, per la caratterizzazione di sistemi supramolecolari su scala nanoscopica a base di cavitandi; il Prof. M.F. Parisi dell’Università di Palermo per la caratterizzazione di sistemi supramolecolari a base di calix[5]areni; i Prof. C. Gaeta e P. Neri dell’Università di Salerno per la caratterizzazione di nuovi sistemi macrociclici host come i prismareni; la Prof.ssa P. Marcos dell’Università di Lisbona per gli studi sui dihomooxacalixareni; il Prof. R. Purrello dell’Università di Catania per lo studio di sistemi calixarene/porfirina; il Prof. P.B. Crowley dell’Università Nazionale d’Irlanda di Galway per lo studio delle interazioni proteina-calixareni; il Prof. S. Key del Politecnico di Losanna per sistemi supramolecolari di coordinazione che formano macro-gabbie; la Prof.ssa M. Bonchio dell’Università di Padova per lo sviluppo di catalizzatori a base di metalli per il water splitting e come antiossidanti; la Dr.ssa V. De Re e il Dr. G. Toffoli del Centro di riferimento oncologico di Aviano per sviluppo di vaccini anti HCV e per lo studio delle interazioni tra irinotecan e HLA-G. In passato le principali e più importanti collaborazioni internazionali sono state svolte con il prof. D.N. Reinhoudt, Laboratory of Supramolecular Chemistry and Technology, Mesa + Research Institute of University of Twente NL, per la determinazione della struttura di nanocapsule basate sulle interazioni ioniche per immagazzinamento e trasporto di piccole molecole; con il prof. W. F. DeGrado, Department of Biochemistry & Biophysics, University of Pennsylvania U.S.A., per gli studi strutturali su metalloproteine artificiali da de-novo design che contengono il motivo "four-helix bundle"; con la prof.ssa L. N. Johnson, Laboratory of Molecular Biophysics, University of Oxford, per gli studi biocristallografici sugli enzimi fosforilasi.