La fisiologia nasce con la filosofia naturale, ovvero con i primi tentativi di scoprire attraverso l'osservazione e il ragionamento principi generali o teorici con cui spiegare la fenomenologia del mondo vivente (e non). Le idee degli antichi sulla natura della vita e sul funzionamento degli organismi, di fatto, alimentavano anche la visione e la spiegazione del mondo inanimato. A partire dal CVII secolo, quando la fisica si distacca da una visione antropocentrica e finalistica dei fenomeni naturali, la fisiologia assume quale scopo quello di ricondurre i fenomeni vitali a spiegazioni del tipo di quelle prodotte dalla nuova fisica : meccaniche e matematiche.