Il lavoro storico di Michele Cassese, realizzato con rigore scientifico e per lo più sulla base di indagini d’archivio e di una notevole documentazione di prima mano, tende a cogliere, nella storia della Chiesa e degli Stati del Nord Italia in età moderna, le modalità di rapporto con i diversi, e in particolare con gli appartenenti a gruppi caratterizzati da una fede religiosa o da una provenienza etnica differente rispetto alla maggioranza.